Traversarea barierei hematoencefalice este un mecanism de transport activ care respecta toate principiile acestui tip de transport. Sint folosite toate variantele respectivului mecanism (transport activ cu caraus, transport facilitat, schimb de molecule, etc.,…) Fiecare molecula transportata are mecanismul sau propriu.

Bariera hematoencefalica este una dintre cele mai stricte bariere de la nivelul organismului si nu permite patrunderea catre tesutul nervos decit a unor anumite molecule pentru care exista mecanism specific de transport. Totusi, creierul este capabil sa sesizeze modificari ale mediului intern prin intermediul semnalelor chimice transportate in torentul sanguin. In acest scop exista citeva zone in care membrana hematoencefalica este fenestrata. Zonele respective formeaza organul circumventricular.